Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms