Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm2056J3QQ02 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm2056J3QQ02 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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