Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms