Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn34c3J3QJW5 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Cldn34c3J3QJW5 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms