Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Nop56Q9D6Z1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms