Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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