Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms