Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Zbtb40Q6PCS8 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Zbtb40Q6PCS8 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Zbtb40Q6PCS8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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