Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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