Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms