Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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