Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx1P81068 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms