Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SrprbP47758 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms