Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms