Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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