Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ptpn9O35239 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ptpn9O35239 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ptpn9O35239 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ptpn9O35239 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms