Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms