Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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