Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms