Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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