Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rb1cc1Q9ESK9 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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