Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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