Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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Smg9Q9DB90 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms