Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Clp1Q99LI9 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Clp1Q99LI9 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms