Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U0

Seh1l, Nucleoporin SEH1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1lQ8R2U0 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Seh1lQ8R2U0 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms