Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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