Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Snx17Q8BVL3 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms