Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms