Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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