Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms