Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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