Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx3-208ENSMUST00000174850 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45294-201ENSMUST00000210685 2102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Trim66-201ENSMUST00000033339 4354 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Muc20-202ENSMUST00000115116 3673 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Lif-202ENSMUST00000066283 4026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42944-201ENSMUST00000198383 3980 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab1-201ENSMUST00000090277 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan18-205ENSMUST00000211392 3709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11537-201ENSMUST00000124865 791 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12728-202ENSMUST00000184254 234 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12728-203ENSMUST00000185012 234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr12-203ENSMUST00000122038 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx1-201ENSMUST00000071103 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gtpbp6Q3U6U5 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms