Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms