Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ttc39dQ0VF76 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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