Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Hoxd10P28359 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms