Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sp100O35892 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms