Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms