Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
H2-M5A7VMS3 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms