Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hdac5Q9Z2V6 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hdac5Q9Z2V6 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms