Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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