Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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Smg9Q9DB90 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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Smg9Q9DB90 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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