Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Pop5Q9DB28 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms