Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn22Q9D7U6 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms