Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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