Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms