Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp27Q8CEG8 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp27Q8CEG8 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms