Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Atg4aQ8C9S8 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg4aQ8C9S8 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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