Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms