Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ccdc18Q640L5 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ccdc18Q640L5 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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