Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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